Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc1P29341 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc1P29341 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms