Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PrkcdP28867 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrkcdP28867 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms