Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd10P28359 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hoxd10P28359 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd10P28359 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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