Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9P28357 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms