Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LoxP28301 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LoxP28301 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LoxP28301 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LoxP28301 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LoxP28301 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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