Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb1P28230 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb1P28230 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms