Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd40lgP27548 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd40lgP27548 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms