Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms