Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd12P23812 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd12P23812 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms