Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ggta1P23336 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ggta1P23336 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms