Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkchP23298 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkchP23298 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms