Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja1P23242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja1P23242 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms