Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb9P20615 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms