Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a2P20490 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a2P20490 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms