Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcer1aP20489 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms