Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf3P20181 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms