Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P20040 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P20040 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P20040 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P20040 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P20040 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P20040 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms