Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cox5bP19536 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cox5bP19536 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms