Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
NefhP19246 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NefhP19246 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NefhP19246 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NefhP19246 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NefhP19246 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NefhP19246 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms