Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RargP18911 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RargP18911 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RargP18911 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RargP18911 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RargP18911 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RargP18911 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RargP18911 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RargP18911 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms