Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18526 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18526 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18526 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18526 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18526 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18526 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P18526 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18526 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18526 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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P18526 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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P18526 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18526 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P18526 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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P18526 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18526 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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P18526 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18526 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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