Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou4f1P17208 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou4f1P17208 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms