Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsaP16675 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtsaP16675 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsaP16675 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsaP16675 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsaP16675 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsaP16675 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms