Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sptan1P16546 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms