Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SptbP15508 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SptbP15508 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SptbP15508 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SptbP15508 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SptbP15508 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SptbP15508 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SptbP15508 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SptbP15508 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms