Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr4a1P12813 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr4a1P12813 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms