Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb1P12658 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb1P12658 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms