Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnp2P11378 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnp2P11378 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Tnp2P11378 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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