Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FlgP11088 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FlgP11088 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FlgP11088 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FlgP11088 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FlgP11088 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FlgP11088 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FlgP11088 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FlgP11088 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FlgP11088 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FlgP11088 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FlgP11088 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FlgP11088 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms