Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spp1P10923 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Spp1P10923 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms