Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P10404 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P10404 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P10404 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P10404 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P10404 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms