Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3cP0DOY1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms