Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Amd1P0DMN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Amd1P0DMN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms