Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc9P09633 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxc9P09633 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc9P09633 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms