Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxb7P09024 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxb7P09024 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxb7P09024 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms