Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxa1P09022 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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