Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeflP08551 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeflP08551 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeflP08551 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NeflP08551 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NeflP08551 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NeflP08551 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NeflP08551 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NeflP08551 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NeflP08551 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NeflP08551 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NeflP08551 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NeflP08551 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NeflP08551 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NeflP08551 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NeflP08551 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NeflP08551 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NeflP08551 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NeflP08551 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NeflP08551 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NeflP08551 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NeflP08551 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NeflP08551 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms