Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr1P08046 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr1P08046 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms