Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna7P06799 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna7P06799 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna7P06799 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna7P06799 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifna7P06799 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifna7P06799 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifna7P06799 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna7P06799 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna7P06799 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ifna7P06799 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ifna7P06799 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms