Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxa4P06798 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxa4P06798 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms