Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06321 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06321 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06321 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06321 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06321 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06321 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06321 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms