Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgamP05555 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgamP05555 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ItgamP05555 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms