Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hbb-bh1P04444 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hbb-bh1P04444 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hbb-bh1P04444 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms