Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01804 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01804 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01804 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01804 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01804 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms