Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01800 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01800 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01800 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01800 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01800 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms