Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01746 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01746 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01746 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01746 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01746 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01746 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01746 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01746 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01746 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms