Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01658 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01658 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01658 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01658 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01658 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01658 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01658 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01658 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms