Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01652 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01652 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01652 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01652 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01652 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01652 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01652 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms