Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01641 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01641 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01641 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01641 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01641 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01641 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01641 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01641 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms