Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01638 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01638 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01638 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01638 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01638 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01638 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms